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肽库合成技术

蛋白和大分子由于传递和稳定性的原因,通常作为药物的时候是无效的。作为大分子,一个蛋白可能会有多种生物功能,每种功能可能由蛋白中某个特定的氨基酸序列的相互作用而形成。在基于多肽的药物发现过程中,常规的一蛋白一实验策略过于耗时耗钱。这要求有一种高通量的能够快速高效的筛选大量化合物的方法。药物开发被分为几个不同的步骤。第一步是去"map"绘制蛋白的活性序列(也就是表位"epitope")。表位绘制将会合成一个由组成原始蛋白的重叠肽序列的肽库(overlapping peptide sequences that makes up the original protein)。如果要决定肽库的序列,需要考虑一下几个因素:
  • 当肽库多肽的长度增加时,所要合成的多肽的数量将会减少。

  • 当偏移数增加时(也就是从原始蛋白序列中转移的多肽氨基酸残基数),所要合成的多肽的数量将会减少。

  • 当多肽序列的长度变长时,复合位点(也就是序列包含表位中所有的重要的残基)的可能性增加。

蛋白序列的长度决定了肽库中多肽的数量。选择更长的序列,更短的偏移数是很理想的方法,但是所需要的费用会大大增加。相反,短多肽序列,需要合成的多肽序列会增多,但是更经济。因为很难预测我们需要的多肽的理想最少数量,所以在实际操作中,通常选用8-20个氨基酸(最好12-16这个范围),偏移数是多肽长度三分之一的方法。
肽库的种类
  • 丙氨酸扫描肽库(Alanine Scanning Library)

    Ala扫描多肽文库是鉴别序列中特定氨基酸对多肽功效影响的一种途径,我们使用Ala依次替换序列中的氨基酸;通过Ala扫描多肽文库以辨出某一特定氨基酸对整个蛋白结构、功能和其他生物活性的影响。

  • 单位点扫描多肽文库(Positional Scanning Library)

    单位点扫描多肽文库是对多肽序列进行优化的一个重要工具,对多肽某个选定的区域或位点被系统地用其他氨基酸替换,通过多肽活性测定以确定这个位点最优的氨基酸。这类肽库有助于研究人员发现在某个特定位置上具有特殊影响或活性的特定区域。

  • 首尾相搭多肽文库(Overlapping Library)

    首尾相搭多肽文库是用于筛选线性或连续性表位的一种常用手段。这种肽库的设计主要由肽长(peptide length)和步移(offset number)两个参数决定。蛋白从N端开始,逐步向C端截取设计后,最后很有可能会剩下一条孤肽(Orphan peptide),我们建议将N端转移一个或者几个氨基酸过来,以保持一致长度。

  • 截头多肽文库(Truncation peptide libraries)

    截头多肽文库被用来确认多肽序列中起到活性作用的最短氨基酸序列,截头多肽文库的建立方法一般是系统性地去除原多肽序列两侧氨基酸而得到的。假如已知某些起重要作用的氨基酸,那么应该保留这些氨基酸序列然后从肽的另外一端开始逐个去除氨基酸开始筛选。

  • 随机多肽文库(Random Peptide Library)

    随机多肽文库的设计是以20种天然氨基酸通过鸟枪式法(shotgun approach)同时地、随机地取代被选择的氨基酸残基。

  • 杂乱肽库(Scrambled Library)

    Scrambled Library的设计是基于对原有多肽氨基酸序列进行内部置换来实现的。它是突变程度最高的多肽文库,被打乱的多肽通常被用于作为阴性对照证实某一特定序列是蛋白功能或活性的关健。它也是一个用来发现新目标的随机筛选工具。

肽库设计的最后一步是提高多肽序列的稳定性,以便维持多肽的性能,我们通常使用以下三种办法来实现:
  • 最常用的方法是使用非天然氨基酸来替代选中的氨基酸位点,比如天然氨基酸对应的高-氨基酸(比如:鸟氨酸(ornithine),高赖氨酸(homolysine),正亮氨酸(norleucine),正缬氨酸(norvaline)或者对应的D型氨基酸)。

  • 另外一个方法是让多肽形成二硫键。

  • 还可以通过化学修饰比如N端氨基的乙酰化和C端的酰胺化来实现。

服务特色
鸿肽生物的六种多肽文库,为高通量药物的筛选和蛋白质相互作用的鉴定提供了可靠的平台。我们多肽文库构建服务特点:
  • 粗品:我们保证纯度大于40%,也有纯度大于90%的情况发生,主要依赖于氨基酸序列, 同时也与合成工艺有关。

  • 纯品:我们提供纯度分别为70%,75%,80%,85%,90%,95%,98%和99%的纯品多肽,客 户可以根据自身实验需求定制。

  • 脱盐和转盐:根据客户要求,我们可以对多肽进行脱TFA盐处理,也可以转为醋酸盐。

  • 合成长度:肽库一般氨基酸个数在1-30之间。

  • 交货期限:一般2-3周,最快1-2周。

  • 质量控制:每条多肽都免费提供合格的HPLC,MS和COA文件。

  • 合成数量:安博生物肽库月通量可达8000-10000条。

  • 售后服务:客户1-2周内可以提出异议,我们免费复测,不合格免费退货,1-3个月内使用 不合格可以免费提供复测,样品免费保存3个月。

  • 技术支持:客户享受经验丰富的技术专家一对一服务。